Отдел этнографии возглавляет д.ф.н. Ф.Г. Галиева, ученица чл.-корр. РАН Р.Г. Кузеева. В отделе также работают д.и.н. г.н.с. Р.Р. Садиков,  к.и.н., в.н.с. И.Г. Петров, к.и.н., в.н.с. М.Г. Муллагулов, к.и.н., с.н.с. Е.Е. Нечвалода, к.и.н. н.с. З.Ф. Хасанова. Ведутся исследования по этнографии башкир, русских, украинцев, белорусов, татар, чувашей, удмуртов, мордвы, марийцев, эстонцев, латышей. Работы сотрудников опубликованы в России, Эстонии, Финляндии, Венгрии, Украине, Чехии, Польше, Болгарии, Казахстане, Туркменистане.

Тема отдела в 2014 г.: «Традиционная культура народов Южного Урала в процессе интеграции и межкультурного взаимодействия» (№01201352612).

Тематика исследований сотрудников:

• Галиева Ф.Г. Русско-башкирское взаимодействие в области обрядовой культуры: к проблеме формирования региональных традиций.
• Садиков Р.Р. Финно-угорские народы Башкортостана: история, культура, демография.
• Петров И.Г. Одежда чувашей Урало-Поволжья в традиционных обрядах перехода: родины, свадьба, похороны поминки. Середина 19 – начало 21 вв.
• Нечвалода Е.Е. Материальная культура русского населения Южного Урала: факторы сохранения и трансформации этнических традиций
• Муллагулов М.Г. Способы жизнеобеспечения башкир: к проблеме сохранения этнических традиций
• Хасанова З.Ф. Межкультурное взаимодействие башкирского и русского населения горно-лесной зоны Башкортостана: на примере поселений и жилищ

Основные показатели за 2014 г:

• 4 монографии (53,6 п.л.);
• 89 статей (43,1 п.л.);
• 26 докладов на 12 международных, всероссийских и межрегиональных конференциях;
• Разработка 1 гранта;
• 1 экспедиция и 1 экспедиционный выезд.

Основной результат: Проведено этнографическое изучение русских, башкир, чувашей, марийцев, удмуртов, мордвы, латышей и эстонцев Башкортостана. Доказано, что взаимодействие и взаимовлияние культур является способом адаптация переселенцев к местным природно-географическим и социальным условиям. В то же время изолированность от центров урбанизации и горнолесной ландшафт способствовали сохранению этнокультурных диалектов до наших дней (русских в северо-восточных районах, башкир инзерского бассейна). Социальные потрясения (война) стимулировали возрождение традиционных хозяйственных занятий (охота, рыболовство, ремесла башкир).